Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim3Q99PE5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms