Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg8Q8VE18 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smg8Q8VE18 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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