Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam20bQ8VCS3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms