Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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