Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alx1Q8C8B0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Alx1Q8C8B0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alx1Q8C8B0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alx1Q8C8B0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alx1Q8C8B0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Alx1Q8C8B0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alx1Q8C8B0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms