Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Npm2Q80W85 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Npm2Q80W85 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Npm2Q80W85 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms