Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms