Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smchd1Q6P5D8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms