Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lcn12Q6JVL5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn12Q6JVL5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms