Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mkrn3Q60764 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn3Q60764 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms