Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb6Q60692 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb6Q60692 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms