Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mdc1Q5PSV9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdc1Q5PSV9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms