Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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