Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtl5Q5DTT4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms