Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb3Q571F5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms