Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lmod2Q3UHZ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmod2Q3UHZ5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms