Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brf2Q3UAW9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brf2Q3UAW9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms