Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf6Q3TWW8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.2 ms