Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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