Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Xrn1P97789 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Xrn1P97789 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms