Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Taf1bP97358 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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