Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RptnP97347 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RptnP97347 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RptnP97347 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RptnP97347 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RptnP97347 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RptnP97347 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RptnP97347 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RptnP97347 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RptnP97347 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RptnP97347 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RptnP97347 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RptnP97347 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RptnP97347 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RptnP97347 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RptnP97347 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RptnP97347 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RptnP97347 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RptnP97347 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RptnP97347 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RptnP97347 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RptnP97347 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RptnP97347 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RptnP97347 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RptnP97347 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RptnP97347 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RptnP97347 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RptnP97347 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RptnP97347 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RptnP97347 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RptnP97347 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RptnP97347 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RptnP97347 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RptnP97347 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RptnP97347 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RptnP97347 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RptnP97347 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RptnP97347 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RptnP97347 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RptnP97347 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RptnP97347 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RptnP97347 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RptnP97347 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RptnP97347 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RptnP97347 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RptnP97347 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RptnP97347 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RptnP97347 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RptnP97347 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RptnP97347 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RptnP97347 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RptnP97347 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RptnP97347 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RptnP97347 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms