Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc1a3P56564 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc1a3P56564 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc1a3P56564 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc1a3P56564 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc1a3P56564 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc1a3P56564 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc1a3P56564 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc1a3P56564 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc1a3P56564 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc1a3P56564 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc1a3P56564 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms