Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NrlP54846 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NrlP54846 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NrlP54846 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NrlP54846 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NrlP54846 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NrlP54846 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NrlP54846 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NrlP54846 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NrlP54846 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NrlP54846 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NrlP54846 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NrlP54846 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NrlP54846 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NrlP54846 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NrlP54846 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NrlP54846 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NrlP54846 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NrlP54846 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NrlP54846 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NrlP54846 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NrlP54846 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NrlP54846 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NrlP54846 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NrlP54846 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NrlP54846 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NrlP54846 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NrlP54846 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NrlP54846 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NrlP54846 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NrlP54846 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NrlP54846 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NrlP54846 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NrlP54846 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NrlP54846 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NrlP54846 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NrlP54846 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NrlP54846 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms