Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc4P54775 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms