Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp1P52624 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp1P52624 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp1P52624 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp1P52624 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp1P52624 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp1P52624 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp1P52624 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp1P52624 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms