Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capza1P47753 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capza1P47753 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capza1P47753 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms