Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp1P29452 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp1P29452 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp1P29452 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp1P29452 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms