Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb9P28076 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms