Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spi1P17433 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spi1P17433 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spi1P17433 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spi1P17433 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms