Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoP15409 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoP15409 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoP15409 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoP15409 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoP15409 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoP15409 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoP15409 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoP15409 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoP15409 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoP15409 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoP15409 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoP15409 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoP15409 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoP15409 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoP15409 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoP15409 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoP15409 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoP15409 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoP15409 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoP15409 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoP15409 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoP15409 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoP15409 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoP15409 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoP15409 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoP15409 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoP15409 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoP15409 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoP15409 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoP15409 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoP15409 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoP15409 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoP15409 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoP15409 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoP15409 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoP15409 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoP15409 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoP15409 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoP15409 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoP15409 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoP15409 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoP15409 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoP15409 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoP15409 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoP15409 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoP15409 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms