Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04944 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04944 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04944 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04944 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04944 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04944 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04944 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04944 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04944 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04944 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04944 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04944 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04944 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04944 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04944 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04944 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04944 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04944 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04944 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04944 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04944 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04944 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04944 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04944 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04944 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04944 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms