Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01725 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01725 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01725 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01725 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01725 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01725 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01725 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01725 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01725 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01725 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01725 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01725 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01725 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01725 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01725 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01725 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01725 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01725 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01725 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01725 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01725 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01725 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01725 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01725 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01725 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms