Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vamp4O70480 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms