Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk1O54908 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dkk1O54908 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms