Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb10O35955 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb10O35955 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 316.5 ms