Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisa8J3QNX5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms