Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms