Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt2E9PUL5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prrt2E9PUL5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms