Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprbB2RU80 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms