Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd4A2AKM2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms