Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf2A2A5Z6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf2A2A5Z6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf2A2A5Z6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms