Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l1A2A259 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l1A2A259 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms