Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms