Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms