Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col5a3Q9JLI2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col5a3Q9JLI2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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