Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herpud1Q9JJK5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms