Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn2Q9ERV1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn2Q9ERV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn2Q9ERV1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkrn2Q9ERV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms