Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms