Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms